Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh8D3Z6W3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rdh8D3Z6W3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rdh8D3Z6W3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms