Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2W7

Cyp3a59, Cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 59, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a59D3Z2W7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cyp3a59D3Z2W7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp3a59D3Z2W7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp3a59D3Z2W7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp3a59D3Z2W7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp3a59D3Z2W7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp3a59D3Z2W7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp3a59D3Z2W7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp3a59D3Z2W7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp3a59D3Z2W7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp3a59D3Z2W7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp3a59D3Z2W7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp3a59D3Z2W7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp3a59D3Z2W7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp3a59D3Z2W7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyp3a59D3Z2W7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms