Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0K6

Rsbn1l, MCG120108, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsbn1lD3Z0K6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsbn1lD3Z0K6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rsbn1lD3Z0K6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rsbn1lD3Z0K6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsbn1lD3Z0K6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsbn1lD3Z0K6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsbn1lD3Z0K6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsbn1lD3Z0K6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms