Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf217D3YYI7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf217D3YYI7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf217D3YYI7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf217D3YYI7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms