Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif28pD3YXS5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kif28pD3YXS5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kif28pD3YXS5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kif28pD3YXS5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kif28pD3YXS5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms