Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mfap1bC0HKD9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mfap1bC0HKD9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mfap1bC0HKD9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mfap1bC0HKD9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mfap1bC0HKD9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mfap1bC0HKD9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mfap1bC0HKD9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mfap1bC0HKD9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mfap1bC0HKD9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mfap1bC0HKD9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mfap1bC0HKD9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mfap1bC0HKD9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mfap1bC0HKD9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Mfap1bC0HKD9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mfap1bC0HKD9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mfap1bC0HKD9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mfap1bC0HKD9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mfap1bC0HKD9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mfap1bC0HKD9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mfap1bC0HKD9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms