Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip3B9EHT4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip3B9EHT4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip3B9EHT4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip3B9EHT4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clip3B9EHT4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip3B9EHT4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clip3B9EHT4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip3B9EHT4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms