Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
1700006A11RikB9EHI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
1700006A11RikB9EHI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
1700006A11RikB9EHI3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
1700006A11RikB9EHI3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
1700006A11RikB9EHI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
1700006A11RikB9EHI3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
1700006A11RikB9EHI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
1700006A11RikB9EHI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
1700006A11RikB9EHI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700006A11RikB9EHI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700006A11RikB9EHI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
1700006A11RikB9EHI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms