Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam71aB7XG49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam71aB7XG49 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fam71aB7XG49 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71aB7XG49 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam71aB7XG49 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam71aB7XG49 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam71aB7XG49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71aB7XG49 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71aB7XG49 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71aB7XG49 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms