Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppfia1B2RXQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppfia1B2RXQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppfia1B2RXQ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppfia1B2RXQ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppfia1B2RXQ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppfia1B2RXQ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppfia1B2RXQ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppfia1B2RXQ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ppfia1B2RXQ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppfia1B2RXQ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia1B2RXQ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppfia1B2RXQ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms