Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrn3B2RS91 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrn3B2RS91 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrn3B2RS91 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrn3B2RS91 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrn3B2RS91 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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