Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otud4B2RRE7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud4B2RRE7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud4B2RRE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Otud4B2RRE7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud4B2RRE7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms