Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ythdc2B2RR83 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ythdc2B2RR83 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ythdc2B2RR83 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Ythdc2B2RR83 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ythdc2B2RR83 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ythdc2B2RR83 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ythdc2B2RR83 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ythdc2B2RR83 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ythdc2B2RR83 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ythdc2B2RR83 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ythdc2B2RR83 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ythdc2B2RR83 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Ythdc2B2RR83 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ythdc2B2RR83 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ythdc2B2RR83 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ythdc2B2RR83 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ythdc2B2RR83 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ythdc2B2RR83 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ythdc2B2RR83 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
Ythdc2B2RR83 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Ythdc2B2RR83 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ythdc2B2RR83 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ythdc2B2RR83 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ythdc2B2RR83 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ythdc2B2RR83 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ythdc2B2RR83 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ythdc2B2RR83 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Ythdc2B2RR83 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ythdc2B2RR83 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ythdc2B2RR83 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Ythdc2B2RR83 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ythdc2B2RR83 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ythdc2B2RR83 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.3 ms