Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC035947B2RQY6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC035947B2RQY6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC035947B2RQY6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC035947B2RQY6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms