Protein–RNA interactions for Protein: B2RPV6

Mmrn1, Multimerin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmrn1B2RPV6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmrn1B2RPV6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mmrn1B2RPV6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmrn1B2RPV6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmrn1B2RPV6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmrn1B2RPV6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmrn1B2RPV6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms