Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed5B2RPU8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed5B2RPU8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed5B2RPU8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed5B2RPU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed5B2RPU8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms