Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brpf3B2KF05 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Brpf3B2KF05 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brpf3B2KF05 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brpf3B2KF05 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brpf3B2KF05 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Brpf3B2KF05 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf3B2KF05 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf3B2KF05 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf3B2KF05 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf3B2KF05 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf3B2KF05 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf3B2KF05 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf3B2KF05 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf3B2KF05 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms