Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PtpruB1AUH1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtpruB1AUH1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtpruB1AUH1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtpruB1AUH1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PtpruB1AUH1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PtpruB1AUH1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PtpruB1AUH1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtpruB1AUH1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtpruB1AUH1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtpruB1AUH1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtpruB1AUH1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtpruB1AUH1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtpruB1AUH1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtpruB1AUH1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
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