Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttll11A4Q9F4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttll11A4Q9F4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttll11A4Q9F4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttll11A4Q9F4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll11A4Q9F4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttll11A4Q9F4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms