Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5640A3KG49 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm5640A3KG49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5640A3KG49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5640A3KG49 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms