Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp8b5A3FIN4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b5A3FIN4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp8b5A3FIN4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp8b5A3FIN4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp8b5A3FIN4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8b5A3FIN4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp8b5A3FIN4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms