Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r232A2RTT5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r232A2RTT5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r232A2RTT5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms