Protein–RNA interactions for Protein: A2CGC2

Btbd35f3, BTB domain-containing 35, family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f3A2CGC2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Btbd35f3A2CGC2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Btbd35f3A2CGC2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Btbd35f3A2CGC2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Btbd35f3A2CGC2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Btbd35f3A2CGC2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Btbd35f3A2CGC2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Btbd35f3A2CGC2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Btbd35f3A2CGC2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Btbd35f3A2CGC2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Btbd35f3A2CGC2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Btbd35f3A2CGC2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms