Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb1A2AQ07 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb1A2AQ07 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb1A2AQ07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb1A2AQ07 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb1A2AQ07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb1A2AQ07 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms