Protein–RNA interactions for Protein: A2APA5

Fam209, 1700029J11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam209A2APA5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam209A2APA5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam209A2APA5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam209A2APA5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam209A2APA5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam209A2APA5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam209A2APA5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam209A2APA5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam209A2APA5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam209A2APA5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam209A2APA5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam209A2APA5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam209A2APA5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam209A2APA5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam209A2APA5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam209A2APA5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam209A2APA5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam209A2APA5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam209A2APA5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam209A2APA5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms