Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpn3A2ALK8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptpn3A2ALK8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptpn3A2ALK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpn3A2ALK8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpn3A2ALK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpn3A2ALK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpn3A2ALK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpn3A2ALK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpn3A2ALK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ptpn3A2ALK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpn3A2ALK8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms