Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdccag3A2AIW0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdccag3A2AIW0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdccag3A2AIW0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms