Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap5A2AGT5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap5A2AGT5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap5A2AGT5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap5A2AGT5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap5A2AGT5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms