Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc163A2AGD7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc163A2AGD7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc163A2AGD7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc163A2AGD7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc163A2AGD7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms