Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2dnl2A2AFH2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2dnl2A2AFH2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2dnl2A2AFH2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2dnl2A2AFH2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms