Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l1A2A259 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2l1A2A259 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l1A2A259 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkd2l1A2A259 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2l1A2A259 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2l1A2A259 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms