Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc194A0A140LIT1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc194A0A140LIT1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc194A0A140LIT1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc194A0A140LIT1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc194A0A140LIT1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc194A0A140LIT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms