Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVR5

Rasgef1a, RasGEF domain family, member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms