Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28360A0A087WR25 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28360A0A087WR25 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28360A0A087WR25 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm28360A0A087WR25 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms