Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ99

Gm29666, Predicted gene 29666, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29666A0A087WQ99 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29666A0A087WQ99 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29666A0A087WQ99 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29666A0A087WQ99 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29666A0A087WQ99 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29666A0A087WQ99 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29666A0A087WQ99 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29666A0A087WQ99 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29666A0A087WQ99 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm29666A0A087WQ99 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm29666A0A087WQ99 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29666A0A087WQ99 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Gm29666A0A087WQ99 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Gm29666A0A087WQ99 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm29666A0A087WQ99 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29666A0A087WQ99 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29666A0A087WQ99 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm29666A0A087WQ99 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29666A0A087WQ99 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29666A0A087WQ99 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29666A0A087WQ99 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm29666A0A087WQ99 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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