Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv2Q9WTR1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms