Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc1Q9QZF2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Gpc1Q9QZF2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms