Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3glb1Q9JK48 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms