Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms