Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssxb10Q6XAR7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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