Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa10P31310 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms