Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms