Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf1B2RRD7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms