Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edf1Q9JMG1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms