Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms