Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms