Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.3 ms