Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apol9aQ8VDU3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol9aQ8VDU3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms