Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms