Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uspl1Q3ULM6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uspl1Q3ULM6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms